Centrum epidemiologie a mikrobiologie
Vedoucí: MUDr. Barbora Macková
Centrum epidemiologie a mikrobiologie (CEM) sestává z devíti oddělení, Akreditačního pracoviště CEM, Národního referenčního centra pro infekce spojené se zdravotní péčí a Laboratoře bakteriální genetiky. V CEM pracují Národní referenční laboratoře (NRL), jejichž činnost pokrývá široké spektrum infekčních onemocnění (A - Z infekce) a mikrobiálních agens.
Laboratorní příručka pro odběr vzorků - LCEM, srpen 2019 (851.58 KB)
Aktuálně z CEM 
Popis a struktura 
Infekční nemoci tématicky 
- A - Z infekce
- Akutní respirační infekce
- Alimentární onemocnění (infekce a otravy z potravin)
- Antibiotická rezistence
- Bioterorismus - patogenní organismy a nemoci
- HIV/AIDS
- Importovaná onemocnění
- Infekční nemoci přenášené uživateli drog
- Infekční onemocnění spojená s migrací
- Legislativa k infekčním nemocem
- Nemoci přenášené hmyzem a roztoči
- Nemoci přenášené vodou
- Nové a znovu se objevující infekční nemoci (Emerging and reemerging infectious disease)
- Sexuálně přenosné nemoci
- Tuberkulóza
- Výskyt infekcí v ČR
- Zoonózy (nemoci zvířat přenosné na člověka)
Výzkumná činnost 
Hlášení infekčních nemocí 
Odborně z CEM 
Spolupráce s ECDC
Popis činnosti CEM
Činnost NRL v CEM je legislativně podložena:
- Zákonem č. 258/2000 Sb., o ochraně veřejného zdraví a o změně některých souvisejících zákonů, ve znění pozdějších předpisů,
- Rozhodnutí Evropského parlamentu a Rady č. 1082/2013/ES o vážných přeshraničních hrozbách a o zrušení rozhodnutí č. 2119/98/ES
- Nařízení Evropského parlamentu a Rady (ES) č. 851/2004, o zřízení Evropského střediska pro prevenci a kontrolu nemocí (ECDC)
- Dokumentem ECDC o činnosti NRL členských států EU „Core functions of microbiology reference laboratories for communicable diseases".
CEM úzce spolupracuje s zejména v programech surveillance infekčních onemocnění (vyhláška číslo 473/2008 Sb.), při spolupráci s Evropským centrem pro prevenci a kontrolu nemocí (ECDC) - hlášení dat do ECDC (TESSy) a při vydávání měsíčníku Zprávy Centra epidemiologie a mikrobiologie (ISSN 1804-8668).
NRL CEM se podílí na řešení tuzemských výzkumných projektů, spolupracují na řešení zahraničních projektů. Výsledkem řešení výzkumných projektů je rozsáhlá publikační činnost.
NRL CEM jsou od roku 2001 akreditovány Českým institutem pro akreditaci (ČIA) jako Zkušební laboratoř (č.subjektu 1206.4) podle ČSN EN ISO/IEC 17025 a od roku 2005 i jako Zdravotnická laboratoř (č.subjektu 8002) podle ČSN EN ISO 15189.
Akreditační pracoviště CEM (AP CEM) organizuje Externí hodnocení kvality (EHK) pro mikrobiologické laboratoře České republiky (i zahraniční) a od června 2010 je pro tuto činnost v rámci (ESPT SZÚ) akreditováno.
Poslední revize textu dne 14.8.2017