PCHL zabezpečuje výkon laboratorních a souvisejících činností v rámci Systému monitorování zdravotního stavu obyvatelstva ve vztahu k životnímu prostředí (MSZO) se specializací na dietární expozici. V rámci MSZO se podílí se na vytváření národního systému vzorkování, zabezpečuje specializovanou preanalytickou přípravu vzorků a jejich analýzu, provádí vývoj, optimalizaci a validaci metod (stanovení vybraných kontaminantů a nutrietů s koncovkou AAS, GC, LC, SPEFO) zabezpečuje zpracování dat  pro oblast dietární expozice. Vytváří systém kvality, zabezpečuje plnění akreditačních kritérií pracoviště. PCHL se věnuje se publikační, přednáškové, osvětové, expertizní činnosti.