PML je zaměřeno na průkaz a stanovení počtu významných bakteriálních patogenů v potravinách, vývoj a aplikaci detekčních metod na principu PCR, typizaci původců alimentárních onemocnění bakteriálního (salmonely, L. monocytogenes, Campylobacter spp., S. aureus) původu fenotypovými a genotypovými metodami, sledování rezistence k antimikrobiálním látkám u patogenních, indikátorových a technologicky významných mikroorganismů. V rámci monitoringu dietární expozice PML realizuje studii MIKROMON zaměřenou na výskyt uvedených patogenů v potravinách k přímé spotřebě. PML se věnuje výzkumné, expertizní, publikační, přednáškové a osvětové činnosti. PML je aktivní v rezortní a mezirezortní spolupráci i na mezinárodním poli (ECDC, EFSA, WHO, AFSSA).

V rámci PML pracuje NRL pro listérie v potravinových řetězcích.