Subsystém probíhá ve 12 městech ČR. Získané výsledky slouží k charakterizaci zdravotních rizik spojených s výživou obyvatelstva ČR. Obsahuje několik projektových částí.

• Monitoring výskytu patogenních bakterií ve vybraných potravinách
• Monitoring výskytu plísní (toxinogenních mikromycetů) ve vybraných potravinách, zejména s ohledem na jejich toxinogenitu (produkce aflatoxinů a ochratoxinů)
• Monitoring výskytu potravin na bázi geneticky modifikovaných organizmů (GMO) na trhu v ČR
• Monitoring dietární expozice populace ČR vybraným chemickým látkám.

Výsledky subsystému IV - Monitoring dietární expozice člověka..