Zdravotní stav obyvatelstva a jeho změny v čase jsou v rámci Systému monitorování sledovány na základě opakovaného dotazníkového šetření nazvaného Studie HELEN - Health, Life Style and Environment. Dotazník je zaměřen na zdravotní stav (osobní a rodinnou anamnézu), na sociální a ekonomické podmínky, na rizikové faktory vzniku chronických neinfekčních onemocnění, související se životním stylem a výživou, a na psychosociální faktory (spokojenost se životem apod.).

Studie Helen se v letech 1998 - 2002 uskutečnila celkem ve 27 městech ČR zařazených do Systému monitorování (první etapa studie).  V letech 2004 - 2005 proběhla stejnou metodikou druhá etapa studie ve 25 městech ČR. Třetí etapa byla realizována v letech 2009 - 2010 v 19 městech ČR, údaje byly zpracovány od 5 103 respondentů.

Součástí tohoto subsystému je také zpracování  vybraných témat demografické a zdravotní statistiky, jako např. vývoj intenzity úmrtnosti v ČR, stárnutí populace z pohledu zdraví, soběstačnosti a kvality života, epidemiologie zhoubných novotvarů, reprodukční zdraví apod.

Odborné zprávy (Studie HELEN, Demografická a zdravotní statistika)