Subsystém zahrnuje sledování zdravotního poškození zaměstnanců jako důsledek negativního vlivu faktorů pracovních podmínek a pracovního prostředí. Obsahuje údaje celostátního monitoringu výskytu nemocí z povolání a ohrožení nemocí z povolání, monitorování expozic faktorům pracovních podmínek na základě kategorizace prací a pracovišť, a monitorování profesionálních expozic chemickým karcinogenům.

Data jsou sbírána a zpracovávána na Centru hygieny práce a pracovního lékařství.