Koliformní bakterie: Slouží jako indikátor obecného bakteriálního znečištění. Při zvýšeném nálezu existuje zvýšená pravděpodobnost žaludečních a střevních problémů. Dříve byly považovány za indikátor fekálního znečištění, ale bylo zjištěno, že existují i koliformní bakterie, které běžně žijí a množí se ve vnějším prostředí.

Termotolerantní koliformní bakterie: Slouží jako indikátor znečištění fekálního původu. Při zvýšeném nálezu existuje zvýšená pravděpodobnost žaludečních a střevních problémů.

Enterokoky: Slouží jako indikátor znečištění fekálního původu. Při zvýšeném nálezu existuje zvýšená pravděpodobnost žaludečních a střevních problémů.

Salmonela: Salmonely jsou skupina baktérií, které mohou způsobovat průjmová onemocnění. Normálně se v prostředí nevyskytuje, je fekálně lidského původu, ale přenášet ji mohou i ptáci. Existuje několik druhů salmonel. Tato bakterie je známa už přes 100 let a byla objeven americkým vědcem Salmonem, po kterém získala i jméno. Bakterie Salmonely způsobují onemocnění Salmonelozu, které se projevuje průjmem, horečkou a břišními křečemi asi po 12 až 72 hodinách od nakažení. Onemocnění obvykle trvá asi 4 – 7 dní. U některých jedinců toto onemocnění může probíhat tak silně, že musí být i hospitalizován.

Enteroviry: Je to skupina virů, která žije v zažívacím traktu teplokrevných živočichů. Už malé množství těchto mikroorganismů může znamenat ohrožení pro zdraví člověka. Mohou způsobovat žaludeční, střevní problémy a některé z nich také infekční žloutenku typu A.

pH: Je hodnota, která ukazuje na množství kationtů vodíků v roztoku, resp. míru kyselosti či zásaditosti roztoku. Její rozmezí je od 0 (kyselost) až po 14 (zásaditost). Obvyklá hodnota pH vody se pohybuje mezi 6 – 8. U povrchových vod slouží měření pH jako indikátor havarijní kontaminace některými chemickými látkami nebo biologickými procesy. S výjimkou extrémních hodnot, ve vodě vzácných, nemá přímý zdravotní význam.

Barva: Barvu vody působí přítomné barvotvorné organické látky, např. huminové (z rozkladu listí, rostlin a půdní organické hmoty), dále sloučeniny kovů (např. železa, manganu nebo mědi), barevné částice planktonu či nerozpuštěných látek, vzácně i průmyslové chemikálie. Voda by měla ideálně být bezbarvá, ale některé vody v tocích nebo jezerech mohou mít neobvykle zabarvení přírodního původu, aniž by to signalizovalo havárii nebo jinou závadu.

Minerální oleje: Do vody se můžou dostat z dopravy (splachy z parkovacích míst a ulic) a z průmyslových havárií. Způsobují povrchové filmy či pach (estetické závady). Přímá zdravotní rizika nejsou velká.

Povrchově aktivní látky: Způsobují pěnu. Při vyšších koncentracích mohou podráždit oči a kůži.

Fenoly: Nadýchání fenolů může podráždit ústní a nosní dutinu, ale taková koncentrace by se mohla najít jen v odpadní průmyslové vodě nebo po nějaké havárii.

Průhlednost: Průhlednost je hloubka, ve které je ještě vidět spouštěná Secchiho deska (bílá nebo s bílými a černými kvadranty). Snížení průhlednosti může být způsobeno buď rozvojem fytoplanktonu nebo přítomností anorganických částic (často po deštích v povodí nad sledovanou lokalitou nebo např. prací v toku). Jedná se o doplňkový ukazatel a přímá zdravotní rizika nejsou. Ve vodách se sníženou průhledností je ovšem značně ztížena záchrana tonoucích. Snížení průhlednosti je však vždy estetickou závadou.

Kyslík rozpuštěný: Je to kyslík rozpuštěný z atmosféry a produkovaný přítomnými řasami a sinicemi. Koncentrace rozpuštěného kyslíku ve vodách s vysokým oživením řas a sinic bude velmi proměnlivá v závislosti na denní době. K vyčerpání kyslíku může docházet při hromadném odumírání vodního květu. To je samozřejmě závažná estetická závada doprovázená nepříjemným zápachem a taková lokalita samozřejmě není vhodná ke koupání.

Viditelné znečištění: Makroskopicky viditelné znečištěni typu odpadky, zbytky dehtu, dřevo, plasty, lahve, obaly ze skla, plastů, gumy nebo jiných látek.

Index saprobity makrozoobentosu: Tento ukazatel slouží k posouzení jakosti vody v tocích a využívá indikačních vlastností na dně žijících drobných živočichů (hmyz a jeho larvy, korýše, plže, ploštěnky apod.). Společenstvo těchto drobných živočichů žijících v čistých vodách se totiž značně liší od vod znečištěných.

Chlorofyl-a: Ve vodě přítomné řasy a sinice vždy obsahují chlorofyl-a, který potřebují k fotosyntéze. Jeho stanovení ve vodě slouží jako míra přítomnosti řas a sinic.

Mikroskopický obraz: Podává informaci o druzích přítomných řas, sinic a drobných živočichů, jakož i informaci o neživých částicích rozptýlených ve vodě.

Celkový fosfor: Fosfor slouží jako živina pro fytoplankton. Jeho nadbytek způsobuje rozvoj fytoplanktonu. Přímý zdravotní dopad na koupající však nemá.

Sinice: Sinice obsahují látky, které způsobují alergie. U koupajícího se člověka, podle toho, jak je citlivý a jak dlouho ve vodě pobývá, se mohou objevit vyrážky, zarudlé oči, rýma. Sinice také mohou produkovat různé toxiny (jedovaté látky). Podle toho, kolik a jakých toxinů se do těla dostane, se liší i projevy: od lehké akutní otravy projevující se střevními a žaludečními potížemi, přes bolesti hlavy, až po vážnější jaterní problémy. Více se můžete dozvědět v článku Sinice a koupání v přírodě.

Vizuální hodnocení: Tento ukazatel slouží k posouzení přítomnosti vodního květu sinic.